राष्ट्रीय जांच एजेंसी और खुफिया ब्यूरो जैसी केंद्रीय एजेंसियों ने केरल के कोझिकोड में चलती ट्रेन में आगजनी के पीछे आतंकी साजिश की पुष्टि की है। एजेंसियोंं की जांच में ये खुलासा हुआ है कि ट्रेन में अपने सह-यात्रियों को आग लगाने वाले शाहरुख सैफी के आतंकवादी संगठनों से संबंध हैं। अलप्पुझा-कन्नूर एग्जीक्यूटिव एक्सप्रेस के यात्रियों पर सैफी ने पेट्रोल छिड़क कर आग लगा दी थी, जिसमें तीन लोगों की मौत हो गई थी जबकि कई अन्य घायल हो गए थे।
केंद्रीय जांच एजेंसियों (NIA, IB) के मुताबिक दिल्ली के शाहीन बाग के रहने वाले शाहरुख सैफी अकेले केरल नहीं गया था। बल्कि पूरी ट्रेन की बोगी को आग लगाकर एक बड़ा हमला करने के उद्देश्य से उसे केरल लाया गया था। खबरों के मुताबिक, आरोपी आतंकवादी विचारधारा से प्रभावित था और एक बड़े आतंकवादी समूह द्वारा अपराध करने के लिए प्रोत्साहित किया गया था। केंद्रीय एजेंसियों को हमले के लक्ष्य के रूप में केरल और अलप्पुझा-कन्नूर कार्यकारी एक्सप्रेस को चुनने के पीछे एक साजिश का संदेह है। एजेंसी ने कहा कि अगर सैफी अपने मंसूबों में कामयाब हो जाता, तो हमला विनाशकारी हो सकता था क्योंकि हिंदुस्तान पेट्रोलियम के तेल टैंक पास में ही थे।